在生物信息学领域,DSSP 是计算蛋白质二级结构的黄金标准工具。libdssp 作为其 C++ 库实现,允许开发者在自己的程序中嵌入 DSSP 算法。然而在实际集成过程中,我发现该库在异常处理和线程安全方面存在一些隐患,...
C++/C
[C语言]数组循环位移三种算法–实现与原理
一、问题引入 我们目前有一个一维的数组序列,其中有n个整数(并非绝对,同样可以为字符串,例如基因序列的分析),要求把下标从0到p(包含p,p小于等于n-1)的数组元素平移到数组最后。 这是一道很明显的数组循...
[C++高性能计算]-CPU加速运算-CUDA程序基础例程
当我们需要进行大规模计算时,我们为了提高计算速度,必然需要GPU加速,例如进行生物信息学单细胞转录组分析时,我们需要对转录组矩阵进行上亿次的计算,如果单用GPU进行计算,速度必然难以满足需求。 对于GPU加...
[C++高性能计算]-牛顿冷却定律模拟物理冷却过程
最近学习NVIDIA官方的CUDA并行计算课程,有一个很好的例子,便跟着讲解,实现了一下,即一个物体(object)随着时间逐渐冷却的模拟过程,直接使用牛顿冷却定量进行模拟,一个对象进行计算,我们使用CPU单线程即可...
C语言描述-年龄比较算法-存活数法和比较法
首先创建两个结构体,一个描述date,一个作为个体student typedef struct date { int year; int month; int day; }date; typedef struct student { char name[20]; date birthday; }student...
C语言-结构体-学生成绩录入-scanf_s()字符串输入缓存区参数问题
在学习结构体时候,在给其赋值时突然报错,详细看是scanf_s()报错了,我们来看一下是什么原因,下面是原始报错代码 #include <stdio.h> typedef struct Studt{ char id[20]; char name[20]; in...

